geruchten en het populaire geloof van een vervalste dood nog steeds wijdverspreid echter, grotendeels gebaseerd op het feit dat voorafgaand aan de moord op Morpheus een paar selecte redpills werden gestuurd een e-mail waarin stond dat hij waarschijnlijk zou “verdwijnen” en verbergen. Net als bij Neo zijn Morpheus’ overblijfselen in de echte wereld nog niet gevonden.
SimulacraEdit
tijdens hoofdstuk 6 leek een figuur op Morpheus., Het nam de vorm aan van een RSI-transmissie, blijkbaar afkomstig uit de echte wereld en verspreid onsamenhangende berichten over Neo ‘ s overleving en gevangenschap door de handen van de Machines. Dit werd later onthuld als niets meer dan een farce gemaakt door de generaal om onenigheid te zaaien tussen Zion en de Machines, een inspanning die hij had gehoopt zou hernieuwen conflict tussen de twee partijen en hem weer doel te geven.
De fake, een Morpheus Simulacrum gemaakt op basis van Zion records van de kapitein, nam een grotere rol op zich toen zijn meester het beval om zichzelf te deactiveren., Het programma negeerde zijn oorspronkelijke programmering en weigerde te stoppen, het programma ging door om, na verloop van tijd, grotere niveaus van zelfbewustzijn en bewustzijn te verkrijgen. Het bleek een belangrijke rol te spelen in het ontsluiten van de Zion RSI Database die werd verworven tijdens de 6e vernietiging van Zion als onderdeel van de hernieuwde oorlog na de Cypherite ontdekking van New Zion. Dit werd echter niet gedaan met kwaadaardige bedoelingen, in feite was de persoonlijkheid van de Simulacrum in het bijzonder onschuldig, meer bezig met de wereld om hem heen en zijn eigen bestaan dan partij te kiezen in een politieke of ideologische strijd.,in latere hoofdstukken speelde de Morpheus Simulacrum een ondersteunende rol in de vervalste dood van het orakel en het daaropvolgende plan om de Oligarchkrachten die de Matrix bedreigen te verzwakken. Benaderd door de Oligarch Halborn tijdens zijn onderzoek naar het leven van de ene, de Simulacrum kil verwierp de acties van de indringer als alleen leiden tot zijn onvermijdelijke nederlaag.