De naam Folly komt van een oud-engelse term die “dichte bladeren” betekent.”Toen Europeanen voor het eerst landden op het eiland in de vroege jaren 1600, ontdekten ze een Inheemse Amerikaanse stam genaamd de Bohickets. Het is onduidelijk wat er met hen gebeurde nadat het land werd overgedragen aan William Rivers in 1696. Piraten waren bekend om te varen langs de kust van South Carolina en de vele inhammen, geluiden, baaien gevormd door barrièreeilanden en zee-eilanden zoals Folly Island. Twee van de meest memorabele waren Edward Teach, bekend als Black Beard, en Stede Bonnet.,Folly Island stond een tijd lang bekend als Coffin Island, niet vanwege doden of begrafenissen, maar omdat het eigendom was van de familie Coffin, plantageeigenaren van Beaufort en Charleston County.de enige Burgeroorlog gerelateerde gevechten op het eiland vond plaats op 10 mei 1863, toen Zuidelijke troepen de Noordelijke troepen aanvielen. Omdat de Zuidelijken op een fact-finding missie waren, waren de gevechten op zeer kleine schaal. Folly werd in augustus 1863 bezet door het noordelijke leger en diende als bevoorradingsdepot en kamp voor de troepen die de stad Charleston belegerden.,Folly Island bleef de rest van de oorlog onder controle van de Unie. Het werd gebruikt als verzamelplaats voor de veldslagen bij Fort Wagner, die werden uitgevochten tussen juli en September 1863. Morris Island was de locatie van Fort Wagner; de Tweede Slag om Fort Wagner werd afgebeeld in de film Glory uit 1989.Bermudiaanse eerste Sergeant Robert John Simmons van Compagnie B van het 54th Massachusetts Volunteer Infantry Regiment schreef een brief van Folly Island kort voordat hij dodelijk gewond raakte bij Fort Wagner. De brief werd gepubliceerd in de New York Tribune op 23 December 1863.,

Folly Island, South Carolina

18 juli 1863;

We zijn op de mars naar Fort Wagner, om het te bestormen. We hebben net onze succesvolle terugtocht van James Island afgerond; we vochten een wanhopige strijd daar donderdagochtend. Drie compagnieën van ons, B, H en K, waren ongeveer anderhalve kilometer voor het regiment op picket. We werden vroeg in de ochtend aangevallen. Onze Compagnie was in het reservaat, toen de buitenposten werden aangevallen door rebellen infanterie en cavalerie. Ik ben gestuurd door onze kapitein, die het bevel voert over een groep mannen om de linkerflank te ondersteunen., De kogels regende vrij om ons heen; toen ik daar kwam vielen de arme jongens om me heen, met zielig gekreun. Onze piketten telde slechts 250 man, aangevallen door ongeveer 900. Het wordt verondersteld door de lijn van de strijd in de verte, dat ze werden ondersteund door reserve van 3.000 man. We moesten vuren en ons terugtrekken naar ons eigen kamp. Een arme Sergeant van ons werd langs mijn kant neergeschoten; verscheidene anderen raakten gewond in mijn buurt.God heeft mij beschermd door deze, mijn eerste vurige, loden beproeving, en ik geef hem de heerlijkheid, en geef mijn lof aan zijn heilige naam., Mijn arme vriend Vogelsang is door de longen geschoten, zijn zaak is kritiek, maar de dokter zegt dat hij het waarschijnlijk overleeft. Zijn bedrijf heeft veel geleden. De arme goede en dappere Sergeant (Joseph D.) Wilson van zijn compagnie, na vier rebellen met zijn bajonet te hebben gedood, werd door de vijfde door het hoofd geschoten. Arme kerel! Moge zijn edele geest rusten in vrede. De generaal complimenteerde de kolonel met de moed en dapperheid van zijn regiment.,in de zomer van 1934 gingen componist George Gershwin en auteur DuBose Heyward naar Folly Island om te werken aan hun Amerikaanse folkopera Porgy and Bess.

Folly Beach wordt af en toe getroffen door orkanen die zich langs de Atlantische kust verplaatsen in de vorm van wind, regen en zware branding, wat stranderosie veroorzaakt. Orkaan Irene in 2011 veroorzaakte ernstige erosie en dwong de sluiting van het Folly Beach County Park, een populaire openbare toegang tot het strand.,de Folly Beach Public Safety en Charleston County Bomb Squad graven nog steeds kanonskogels op na zware stormen, met name orkaan Matthew. Tijdens Matthew werden 16 kanonskogels ontdekt in wat EOD-leden een “laadpositie”noemden. Het is waarschijnlijk dat dit Burgeroorlog tijdperk Unie kanonskogels achtergelaten als gevolg van hun nabijheid tot elkaar en het feit dat er geen was ontploft. Meest recent werd op 13 maart 2017 een grote kanonskogel gevonden, waarschijnlijk van de Confederatie, aan het uiterste noordoostelijke einde van het eiland. De Charleston County EOD onderzoekt het nog steeds.