1977 hölls långa uppskjutna nationella val och Gandhi och hennes parti sveptes från kontoret. Nästa år bröt Gandhis anhängare från Kongresspartiet och bildade Kongresspartiet (I), med ”Jag” står för ”Indira.”Senare 1978 fängslades hon kort för officiell korruption. Strax efter att det styrande Janata-partiet föll ihop vann Kongresspartiet (i), med Indira som huvud, en spektakulär valseger 1980, och Gandhi var återigen premiärminister.,
i början av 1980-talet intensifierade flera regionala stater sin uppmaning till större autonomi från New Delhi, och Sikhs secessionistiska rörelse i Punjab tillgrep våld och terrorism. År 1984 satte Sikh-ledarna upp bas i sitt heliga gyllene tempel i Amritsar. Gandhi svarade genom att skicka in den indiska armén, och hundratals sikher dödades i regeringens angrepp. I vedergällning sköt Sikh-medlemmarna i Gandhis egen livvakt ner henne på grund av sitt hem den 31 oktober 1984. Hon efterträddes av sin son Rajiv Gandhi.