ut ur skåpet
surrade av kritik, trött och angelägen om att reparera sin privata förmögenhet, Hamilton lämnade skåpet den 31 januari 1795. Hans inflytande, som en inofficiell rådgivare, fortsatte dock lika starkt som någonsin. Washington och hans kabinett rådfrågade honom om nästan alla politiska frågor. När Washington bestämde sig för att gå i pension vände han sig till Hamilton och frågade sin åsikt om den bästa tiden att publicera sitt farväl., Med sitt öga på det kommande presidentvalet rådde Hamilton att undanhålla meddelandet till några månader före presidentvalet. Efter detta råd gav Washington sitt avskedstal i September 1796. Hamilton utarbetade det mesta av adressen, och några av hans idéer var framträdande i den. I valet gick Federalistiska ledare över Hamiltons påståenden och nominerade John Adams till ordförandeskapet och Thomas Pinckney till vice ordförandeskapet., Eftersom Adams inte verkade ägnas åt Hamiltonska principer försökte Hamilton manipulera valhögskolan för att göra Pinckney president. Adams vann valet, och Hamiltons intriger lyckades bara så misstro inom sitt eget parti. Hamiltons inflytande i regeringen fortsatte dock, för Adams behöll Washingtons kabinett, och dess medlemmar konsulterade Hamilton om alla politiska frågor, gav honom konfidentiell information och uppmanade i praktiken sin politik på presidenten.,
När Frankrike bröt förbindelserna med USA stod Hamilton för fasthet, men inte omedelbart krig; men efter misslyckandet av ett fredsuppdrag som president Adams hade skickat till Paris 1798, följt av publiceringen av sändningar som förolämpade USA: s suveränitet, ville Hamilton placera landet under vapen. Han trodde till och med att fransmännen, med vilken Usa nu blev engagerad i ett odeklarerat sjökrig, skulle kunna försöka invadera landet., Hamilton sökte befälet över den nya armén, även om Washington skulle vara dess titulära Huvud. Adams motsatte sig Hamiltons önskningar, men i September 1798 tvingade Washington honom att göra Hamilton näst i befälet över armén, inspektör general, med rangen av generalmajor. Adams förlät aldrig Hamilton för denna förnedring. Hamilton ville leda sin armé in i Spaniens Louisiana och Floridas och andra punkter söderut men aldrig gjorde. Genom oberoende diplomati, Adams höll gräl från att sprida sig och på order av kongressen upplöstes den provisoriska armén., Hamilton avgick sin provision i juni 1800. Under tiden hade Adams rensat sitt skåp av de han betraktade som ” Hamiltons spioner.”
i vedergällning försökte Hamilton förhindra Adams omval. I oktober 1800 cirkulerade han Privat en personlig attack mot Adams, allmänhetens uppförande och karaktär av John Adams, Esq., Förenta staternas President. Aaron Burr av New York, den republikanska kandidaten till vicepresident och Hamiltons politiska fiende, fick en kopia och fick den publicerad., Hamilton var då tvungen att erkänna sitt författarskap och att få sitt gräl med Adams i det öppna, en fejd som avslöjade en irreparabel schism i federalistpartiet. Thomas Jefferson och Aaron Burr vann valet, men eftersom båda hade fått samma antal valröster, valet mellan dem för president kastades in i representanthuset. Hata Jefferson, federalisterna ville kasta valet till Burr. Hamilton hjälpte till att övertala dem att välja Jefferson istället., Genom att stödja sin gamla republikanska fiende, som vann ordförandeskapet, förlorade Hamilton prestige inom sitt eget parti och slutade nästan sin offentliga karriär.