mięsień sercowy głównie metabolizuje tłuszcz na energię, a metabolizm acylo-CoA został zidentyfikowany jako krytyczna cząsteczka we wczesnym stadium niewydolności pompy mięśnia sercowego.

komórkowa zawartość acylo-CoA koreluje z insulinoopornością, co sugeruje, że może pośredniczyć w lipootoksyczności w tkankach innych niż tłuszczowe. Acylo-CoA: acylotransferaza diacyloglicerolu (DGAT) odgrywa ważną rolę w metabolizmie energetycznym ze względu na kluczowy enzym w biosyntezie trójglicerydów., Syntetyczna rola DGAT w tkance tłuszczowej, takiej jak wątroba i jelita, miejsca, w których endogenny poziom jego aktywności i synteza trójglicerydów są wysokie i stosunkowo jasne. Ponadto wszelkie zmiany poziomu aktywności mogą powodować zmiany ogólnoustrojowej wrażliwości na insulinę i homeostazy energetycznej.

rzadka choroba zwana wielokrotnym niedoborem dehydrogenazy acylo-CoA (MADD) jest zaburzeniem metabolizmu kwasów tłuszczowych. Acylo-CoA jest ważne, ponieważ enzym ten pomaga wytwarzać acylo-CoA z wolnych kwasów tłuszczowych, a to aktywuje kwas tłuszczowy do metabolizmu., To upośledzone utlenianie kwasów tłuszczowych prowadzi do wielu różnych objawów, w tym ciężkich objawów, takich jak kardiomiopatia i choroby wątroby oraz łagodnych objawów, takich jak epizodyczny rozkład metaboliczny, osłabienie mięśni i niewydolność oddechowa. MADD jest chorobą genetyczną, spowodowaną mutacją w genach ETFA, ETFB i ETFDH. MADD jest znany jako „zaburzenie autosomalne recesywne”, ponieważ aby dostać się do tego zaburzenia, trzeba otrzymać ten gen recesywny od obojga rodziców.