Boniface gyorsan elbocsátotta a többi küldöttet, és megkérte Dantét, hogy maradjon Rómában. Ugyanakkor (1301. November 1.) Charles de Valois fekete Guelfekkel érkezett Firenzébe, aki a következő hat napban elpusztította a város nagy részét, és sok ellenséget megölt. Új fekete Guelph-kormányt hoztak létre, Messer Cante Dei Gabrielli di Gubbio-t pedig Firenze Podestà-jává nevezték ki. Dante két évre száműzetésbe került, és elrendelte, hogy fizessen egy nagy halom pénzt.,
Dante nem fizette ki a pénzt, részben azért, mert azt hitte, hogy nem bűnös, részben azért, mert Firenzében minden igényét ellopták a fekete Guelphok. Életfogytiglani száműzetésre ítélték, és ha a pénz megfizetése nélkül tér vissza Firenzébe, máglyán elégethetik.
száműzetésben elkezdte keresni az isteni Komédia alapját, egy 100 kantos művet, amely három, egyenként harminchárom kantos könyvre oszlik, egyetlen bevezető kantóval.
Bartolomeo I della Scala vendégeként ment Veronába, majd Liguriában Sarzanába költözött., Később állítólag Luccában élt Madame Gentuccával. Egyes források szerint 1308 és 1310 között Párizsban is tartózkodott. 1310-ben a Luxemburgi VII.Henrik római császár 5000 katonát vonzott Olaszországba. Dante látta benne egy új Károly, aki visszaállítja a Szent Római Császár irodáját, hogy újra vegye Firenzét a fekete Guelfekből. Írt Henriknek és több olasz hercegnek, követelve, hogy pusztítsák el a fekete Guelfeket., A vallást és a magánügyeket keverve Isten legnagyobb haragjára hivatkozott a városával szemben, és számos konkrét célpontot javasolt, amelyek egybeestek személyes ellenségeivel. Ez idő alatt írta az isteni Komédia első két könyvét.
amikor Dante meghalt Ravennában, a Ravennai test őrei a csontokat a kolostor hamis falába helyezték. Ennek ellenére 1829-ben sírt építettek neki Firenzében a Santa Croce-Bazilikában. Ez a sír Azóta üres, Dante teste Ravennában maradt, messze attól a földtől, amelyet annyira szeretett., Sírjának homlokzata Firenzében a “L’ altissimo poeta” – t olvassa, ami nagyjából azt jelenti, hogy “tiszteljük a legmagasztosabb költőt”.