Fylogeni – definisjon
Innholdsfortegnelse
Fylogeni refererer til den evolusjonære historien til utviklingen av en art eller av en taksonomisk gruppe av organismer. Den fylogenetisk relasjoner er avbildet i form av et fylogenetisk tre, dvs. et tre-diagram som viser hvordan en taxon er nært eller distantly knyttet til en annen taxon., Treet diagrammet viser fylogenetisk relasjoner er basert på den molekylære sekvensering data analyser så vel som på morfologiske data matriser.
Fylogeni definisjon
definisjonen av fylogeni i biologi knytter seg til den evolusjonære historie eller utvikling av en gruppe av organismer, slik som en stamme eller en etnisk gruppe. Den fylogeni mening er noe som ligner på sikt phylogenesis og som sådan, de er noen ganger brukt om hverandre., Imidlertid, i en strengere forstand, phylogenesis refererer til den biologiske prosessen som en bestemt taxon eksisterer. Phylogenetics er en annen beslektet begrep. Det refererer til det vitenskapelige studiet av fylogeni. Det gjelder molekylære og analytiske metoder i å forstå evolusjonære historie og prosesser som er involvert under utviklingen av en art eller av et taxon. Fylogeni er et resultat av studier og analyser av viktige forekomster av levende organismer og det er representert ved et tre-diagram kalles fylogenetisk tre., Phylogenetics forsøk på å forklare den evolusjonære relatedness blant ulike grupper av organismer gjennom molekylære sekvensering data og morfologiske data matriser.
Etymologi
begrepet fylogeni ble avledet fra det tyske Phylogenie som ble skapt av Ernst Haeckel i 1866., Phylogenie, i sin tur, kom fra de greske ordene φῦλον (phûlon), som betyr «stamme», «slekten», eller «arter» og -γένεια (-géneia, -geny), som betyr «generasjon» eller «produksjon». Synonymer: phylogenesis.
Fylogeni vs. ontogeny
Begge fylogeni og ontogeny avtaler med opprinnelsen og utviklingen av organismer. De er begge opptatt med utviklingsmessige historier. Imidlertid, ontogeny er forskjellig fra fylogeni på en slik måte at det ser ut gjennom den historiske utviklingen av en organisme i sin egen tidslinjen (f.eks., fra den enkleste til de mest komplekse form) og ikke på sin evolusjonære historie. Dermed ontogeny er til utvikling av en individuell organisme som fylogeni er til utviklingen av en art.
Fylogeni vs. taksonomi
Mens fylogeni er opptatt med den evolusjonære relatedness og historie av organismer, det er ikke bekymret med identifisering av disse organismene., Snarere, det er den største bekymringen av taksonomi. For å være mer presis, taksonomi er den gren av vitenskapen som er bekymret hovedsakelig med å identifisere, navngi og klassifisere organismer. Det setter organismer i taksonomisk rekker, f.eks. domene, storbritannia, phylum eller divisjon, klasse, slekt, art. Likevel, klassifisering er basert på morfologi og fylogeni av organismer og phylogenetics gir informasjon til bruk i løpet av identifisering og klassifisering av organismer., Så mens taksonomi er bekymret hovedsakelig med identifisering og klassifisering av organismer, fylogeni gir data for slike formål, og et fylogenetisk klassifisering ville være en som er i stor grad basert på molekylær fylogeni data.
Molekylær fylogeni
Molekylær fylogeni, en gren av fylogeni, gjør bruk av molekylære sekvensering for å studere evolusjonære tilhørighet og bakgrunn. Molekylær sekvensering, i denne sammenheng, er et nyttig verktøy til å forstå phylogenies av ulike taksa. Å basere relatedness på morfologi, anatomi, fysiologi, og livssyklus kan være forvirrende., Det er tilfeller der noen trekk er lett identifiseres som enten like eller ulike. Men det er også tilfeller når deres likheter og ulikheter er vage. Videre er det også situasjoner når to artene synes å tilhøre en felles taxon men etter å analysere deres genomer de viste seg å være evolusjonære fjernt.
Heldigvis, mer avanserte verktøy for studier og forskning har blitt tilgjengelige, og de har gitt forskerne et mer pålitelig grunnlag for fastsettelse og analysere fylogeni., Nukleinsyrer, som DNA og RNA, lagre og beholde visse genetiske informasjon som forskere bruker som hint av troverdige evolusjonære opphav og historie. Det er fordi disse biomolecules er heritable.
Ved å sammenligne slike opplysninger ved hjelp av et dataprogram, graden av relatedness og mellom organismene som kan gjenkjennes. Ved å se på genom (samt proteiner som kode for), den evolusjonære relatedness kan bli analysert, dvs. om organismer som er nært i slekt eller fjernt., En av de mest brukte for molekylær fylogeni studier og analyser er sekvensen av small subunit av ribosom-RNA.(1) analyser som kan være avledet fra slike kilder har fordelen av å gi kvantifiserbare data. Den relatedness mellom taksa kan bli demonstrert gjennom molekylære sekvensering data og morfologiske data matriser.,
Fylogeni diagrammer
Fylogeni kan være representert ved et tre-diagram kalles fylogenetisk tre (også kalt evolusjonære treet). Diagrammet viser relasjoner mellom organismer eller relatedness mellom taksa. Det er opprettet basert på molekylær fylogeni studier og på morfologiske data., Ved å sammenligne organismer basert på fellestrekk og incongruences, deres evolusjonære forhold kan etableres og representert i et tre-diagram.
Et fylogenetisk tre kan være forankret eller unrooted. En rotfestet fylogenetisk tre implicates en felles stamfar hvor nært knyttet taksa nedstammet fra. En unrooted fylogenetisk tre, i kontrast, viser ikke en felles stamfar, men det hypothesizes på graden av evolusjonære relatedness mellom taksa. Treet diagrammet er viktig som det hjelpemidler i å forstå biologisk mangfold, utvikling, genetikk og økologi til de ulike grupper av organismer., Ved å se på plasseringen og lengden på «grener», vil en lett kunne antyde hvordan en gruppe kan være evolusjonære knyttet til en annen. De som er sammen impliserte evolusjonære relatedness. Den interne noder betegne hypotetisk felles stamfar.
Tree of life
I biologi, the tree of life er en skjematisk modell som viser utviklingen av organismer både utdødd, og den levende. Sporing bunnen eller ved roten av treet fører til siste universal common ancestor av livet på jorden. Som for tips, de representerer den levende organismer i dag, og noen er den nyeste i den evolusjonære avstamning. I 2016, en moderne metagenomics tree of life er foreslått.,(2) diagrammet inkluderer 92 bakteriell phyla, 26 archaeal phyla, og alle fem av de Eukaryote supergroups.
Mikrobiell fylogeni
Mikrobiell fylogeni er den evolusjonære historie eller utvikling av mikroorganismer, slik som bakterier., Lik alle andre tidlige phylogenies, treet diagrammer brukes til å skildre evolusjonære relasjoner var basert på morphologies, og i dette tilfellet, bakterielle struktur. I 1960-årene til 1970-tallet, mikrobiell phylogenetics dukket opp og forskere begynte å lage fylogenetisk trær basert på nukleinsyrer og protein sekvensering snarere enn på anatomi og fysiologi.(3) En av de mest markante bidragsytere mikrobiell phylogenetics er Carl Woese. Han studerte small subunit rRNA oligonukleotider av bakterier og sammenlignet dem for å finne ut evolusjonære relatedness., Han og hans team var den første til å foreslå at archaebacteria var forskjellige fra bakterier. (4) Dette førte til tre-domene systemet for klassifisering av organismer: domene Bakterier, domenet Archaea, og domenet Eucarya, og dermed, det å avvise den gamle prokaryote-eukaryote dikotomi. Moderne fylogenetisk studier viser at det er 92 bakteriell phyla. Likevel, dette tallet er ikke offisiell ennå. Videre er det også noe offisielt akseptert taksa over klasse rang i mikrobiell klassifisering.,
Dyr fylogeni
Den fylogenetisk tre av dyr som viser utviklingen av dyr organer er en spesiell fylogeni eksempel. Det viser dyr fylogeni er vilkårene for utviklingen av dyr organer. I denne type diagram, den evolusjonære forhold av store dyr linjene kan utledes basert på organ-nivå i organisasjonen., For eksempel, fordøyelsessystemet syntes å først kan virke som om 600 millioner år siden, og i omtrent hundre millioner år senere, lever utviklet seg i vertebrater, slik som mennesker.,
Viktig
Fylogeni knytter seg til den evolusjonære historien til en taksonomisk gruppe av organismer, og det er brukt som grunnlag i phylogenetics som sistnevnte omhandler forhold av en organisme til andre organismer i henhold til evolusjonære likheter og forskjeller., Dermed, fylogeni er viktig i det vitenskapelige studiet av identifisering, klassifisering, økologi, og evolusjonære historie av organismer. Det viser relasjoner mellom grupper av organismer (taksa) spesielt forskjeller og likheter mellom dem. Det blir viktig å forstå biologisk mangfold, genetikk, utvikling og økologi blant grupper av organismer. Bortsett fra phylogenetics, er det også viktig innen taksonomi. Det utvider på grunnlag av evolusjonære relasjoner av organismer fra morfologiske aspekt til genetisk konstruksjoner av organismer.,
Begrensninger
Slutninger avledet fra fylogenetisk studier er ikke absolutte. Dataene fra genom studier kan muligens inneholder feilaktige data. For eksempel, den genom analyser kan være basert på feil data, f.eks. at de feilaktig av horisontale genet overføring mellom arter.(5) Fylogeni som er basert på flere gener eller proteiner fra forskjellige genom kilder (f.eks. kjernefysiske eller mitokondrie) er også sannsynlig å være mer presis enn på et enkelt gen eller protein alene. Ellers, analyse kan være en fylogeni av genet, og ikke av arter., Another important limitation is the lack or insufficiency of quality DNA sample from extinct species.
See also
- Evolution
- Phylogenetics
- Phylogenesis
- Evolution
- Taxonomy
- Last universal common ancestor
- Ontogeny