Ulos kaapista
Iski kritiikkiä, väsynyt ja ahdistunut korjata hänen yksityisiä omaisuuksia, Hamilton jätti hallituksen 31. tammikuuta 1795. Hänen vaikutusvaltansa epävirallisena neuvonantajana kuitenkin jatkui yhtä vahvana kuin ennenkin. Washington ja hänen kabinettinsa konsultoivat häntä lähes kaikissa politiikan asioissa. Kun Washington päätti jäädä eläkkeelle, hän kääntyi Hamiltonin puoleen kysyen mielipidettään siitä, mikä olisi paras aika julkaista jäähyväiset., Hänen silmä on tulossa presidentinvaalit, Hamilton neuvoi ennakonpidätys ilmoitus, kunnes muutaman kuukauden ennen kokousta presidentin valitsijamiehet. Tämän neuvon jälkeen Washington piti Jäähyväispuheensa syyskuussa 1796. Hamilton laati suurimman osan puheesta, ja osa hänen ajatuksistaan oli siinä näkyvästi esillä. Vaaleissa, Federalististen johtajien ohitti Hamiltonin väitteet ja ehdolla John Adams puheenjohtajavaltion ja Thomas Pinckney varapresidentiksi., Koska Adams ei näy omistettu Hamiltonin periaatteet, Hamilton yritti manipuloida vaaleja college, jotta Pinckney presidentti. Adams voitti vaalit, ja Hamiltonin juonittelu onnistui vain kylvämään epäluottamusta oman puolueensa sisällä. Hamilton on vaikutusvaltaa hallitus jatkoi kuitenkin Adams säilyttää Washington on kaappi, ja sen jäseniä on kuultu Hamilton kaikissa asioissa politiikkaa, antoi hänelle luottamuksellisia tietoja, ja vaikutus kehotti hänen politiikkansa presidentti.,
Allyn Cox, Arkkitehti Capitol
Kun Ranska rikkoi suhteet yhdysvaltoihin, Hamilton oli kiinteyttä, mutta ei välittömästi sodan; kuitenkin epäonnistumisen jälkeen rauhan asialla, että Presidentti Adams oli lähettänyt Pariisista vuonna 1798, jonka jälkeen julkaiseminen lähettää loukkaavia YHDYSVALTAIN suvereniteettia, Hamilton halusi sijoittaa maan alle aseita. Hän jopa uskoi, että ranskan, jonka kanssa yhdysvallat nyt tuli mukana pimeän merivoimien sota, saattaa yrittää hyökätä maahan., Hamilton haki uuden armeijan komentoa, vaikka Washington olisi sen titulaaripää. Adams vastusti Hamiltonin toiveet, mutta syyskuussa 1798 Washington pakotti hänet tekemään Hamilton toinen komento armeijan, ylitarkastaja, sijoitus kenraalimajuri. Adams ei koskaan antanut Hamiltonille anteeksi tätä nöyryytystä. Hamilton halusi johdattaa armeijansa Espanjan Louisianaan ja Floridoihin ja muihin pisteisiin etelään, mutta ei koskaan. Riippumattoman diplomatian kautta Adams esti riidan leviämisen ja Kongressin käskystä hajotti väliaikaisen armeijan., Hamilton erosi tehtävästään kesäkuussa 1800. Sillä välin Adams oli puhdistanut kabinettinsa niistä, joita hän piti ”Hamiltonin vakoojina.”
kostoksi Hamilton yritti estää Adamsin uudelleenvalinnan. Lokakuussa 1800 hän kiersi yksityisesti henkilökohtaisen hyökkäyksen Adamsia, John Adamsin julkista käytöstä ja Esq: n luonnetta vastaan., Yhdysvaltain presidentti. Republikaanien varapresidenttiehdokas ja Hamiltonin poliittinen vihollinen Aaron Burr New Yorkista hankki kopion ja teetti sen julkaistavaksi., Hamilton oli sitten pakko tunnustaa hänen tekijää ja tuoda hänen riidellä Adams osaksi auki, vihanpito, joka paljasti, korjaamaton skisma Federalistinen Puolue. Thomas Jeffersonin ja Aaron Burr voitti vaalit, mutta koska molemmat olivat saaneet yhtä monta ääntä, valinta niiden välillä presidentti heitettiin Talon Edustajia. Jeffersonia vihaavat federalistit halusivat heittää vaalit Burrille. Hamilton auttoi suostuttelemaan heidät valitsemaan Jeffersonin sijaan., Tukemalla hänen vanha Republikaanien vihollinen, joka voitti puheenjohtajuus, Hamilton menetti arvostusta oman puolueensa sisällä ja lähes päättyi hänen julkisen uransa.