ud af kabinettet
Lashed af kritik, træt og ivrig efter at reparere sin private formue, forlod Hamilton kabinettet den 31.Januar 1795. Hans indflydelse, som uofficiel rådgiver, fortsatte dog så stærk som nogensinde. Washingtonashington og hans kabinet hørte ham om næsten alle politiske spørgsmål. Da Washingtonashington besluttede at gå på pension, vendte han sig til Hamilton og spurgte sin mening om det bedste tidspunkt at offentliggøre sit farvel., Med sit øje på det kommende præsidentvalg rådede Hamilton om at tilbageholde meddelelsen indtil et par måneder før præsidentvalgernes møde. Efter dette råd gav Washingtonashington sin afskedstale i September 1796. Hamilton udarbejdet det meste af adressen, og nogle af hans ideer var fremtrædende i det. Ved valget, føderalistiske ledere gået over Hamilton ‘ s krav og nomineret John Adams for formandskabet og Thomas Pinckney for vice formandskab., Fordi Adams ikke synes afsat til Hamiltonian principper, Hamilton forsøgt at manipulere electoral college for at gøre Pinckney formand. Adams vandt valget, og Hamiltons intriger lykkedes kun at så mistillid inden for sit eget parti. Hamilton ‘s indflydelse i Regeringen fortsatte dog, for Adams beholdt cabinetashington’ s kabinet, og dets medlemmer hørt Hamilton om alle spørgsmål af politik, gav ham fortrolige oplysninger, og i realiteten opfordrede hans politik på formanden.,
Når Frankrig brød forbindelserne med de Forenede Stater, Hamilton stod for fasthed, dog ikke øjeblikkelig krig; men efter den fiasko af en fredsmission, at Præsident Adams havde sendt til Paris i 1798, efterfulgt af offentliggørelsen af forsendelser fornærmende at USA suverænitet, Hamilton ønskede, at landet under armene. Han troede endda, at franskmændene, som USA nu blev engageret i en sort flådekrig, kunne forsøge at invadere landet., Hamilton søgte kommandoen over den nye hær, selvom Washingtonashington ville være dets titulære hoved. Adams modstod Hamilton ‘ s ønsker, men i September 1798 forcedashington tvang ham til at gøre Hamilton anden i kommandoen over hæren, generalinspektøren, med rang af generalmajor. Adams tilgav aldrig Hamilton for denne ydmygelse. Hamilton ønskede at føre sin hær ind i Spaniens Louisiana og Floridas og andre punkter syd, men aldrig gjorde. Gennem uafhængigt diplomati holdt Adams striden fra at sprede sig og på Kongresordenen opløste den midlertidige hær., Hamilton fratrådte sin kommission i Juni 1800. Mellemtiden Adams havde renset sit kabinet af dem, han betragtes som ” Hamiltons spioner.”
som gengældelse forsøgte Hamilton at forhindre Adams genvalg. I Oktober 1800 han privat rundsendt et personligt angreb på Adams, den offentlige adfærd og karakter af John Adams, es.., Præsident for De Forenede Stater. Aaron Burr fra ne.York, den republikanske kandidat til vicepræsident og Hamiltons politiske fjende, fik en kopi og fik den offentliggjort., Hamilton blev derefter tvunget til at anerkende hans forfatterskab og til at bringe hans skænderi med Adams i det fri, en fejde, der afslørede en uoprettelig splittelse i føderalistpartiet. Thomas Jefferson og Aaron Burr vandt valget, men, fordi begge havde modtaget det samme antal valg stemmer, valget mellem dem til præsident blev kastet ind i Repræsentanternes Hus. Hader Jefferson, Federalisterne ønskede at kaste valget til Burr. Hamilton hjalp med at overtale dem til at vælge Jefferson i stedet., Ved at støtte sin gamle republikanske fjende, der vandt formandskabet, mistede Hamilton prestige inden for sit eget parti og sluttede næsten sin offentlige karriere.